Add ability to transpose input data
[loomr.git] / man / subset.loom.Rd
index 5135e388783fb7e779a2848ba63fbf1124a1183d..c9034e4f75b6c38a947ed58bfce0826951369300 100644 (file)
@@ -4,21 +4,23 @@
 \alias{subset.loom}
 \title{Subset a loom file}
 \usage{
-\method{subset}{loom}(x, m, n, filename, overwrite = FALSE,
-  display.progress = TRUE, ...)
+\method{subset}{loom}(x, m = NULL, n = NULL, filename = NULL,
+  overwrite = FALSE, display.progress = TRUE, ...)
 }
 \arguments{
 \item{x}{A loom object}
 
-\item{m}{Rows (genes) to subset}
+\item{m}{Rows (genes) to subset, defaults to all rows}
 
-\item{n}{Columns (cells) to subset}
+\item{n}{Columns (cells) to subset, defaults to all columns}
 
-\item{filename}{Filename for new loom object}
+\item{filename}{Filename for new loom object, defaults to ...}
 
 \item{overwrite}{Overwrite \code{filename} if already exists?}
 
 \item{display.progress}{Display progress as we're copying over data}
+
+\item{...}{Ignored for now}
 }
 \value{
 A loom object connected to \code{filename}