Fixes to batch iteration. Allow skipping of validation due to issues with large datasets
[loomr.git] / man / create.Rd
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2 % Please edit documentation in R/loom.R
3 \name{create}
4 \alias{create}
5 \title{Create a loom object}
6 \usage{
7 create(filename, data, gene.attrs = NULL, cell.attrs = NULL,
8   layers = NULL, chunk.dims = "auto")
9 }
10 \arguments{
11 \item{filename}{The name of the new loom file}
12
13 \item{data}{The data for \code{/matrix}, should be cells as rows and genes as columns}
14
15 \item{gene.attrs}{A named list of vectors with extra data for genes, each vector must be as long as the number of genes in \code{data}}
16
17 \item{cell.attrs}{A named list of vectors with extra data for cells, each vector must be as long as the number of cells in \code{data}}
18
19 \item{chunk.dims}{A one- or two-length integer vector of chunksizes for \code{/matrix}, defaults to 'auto' to automatically determine chunksize}
20 }
21 \value{
22 A connection to a loom file
23 }
24 \description{
25 Create a loom object
26 }
27 \seealso{
28 \code{\link{loom-class}}
29 }