README.md

   1 # loomR
   2
   3 ### An R interface for loom files
   4
   5 For more information on loom files, please see the documentation for [loompy](https://github.com/linnarsson-lab/loompy)
   6
   7 ## Dependencies
   8
   9 loomR depends on:
  10  - [R](https://cran.r-project.org/) v3.4.x
  11  - The [hdf5r](https://github.com/hhoeflin/hdf5r) package
  12  - The HDF5 [C++ API](https://support.hdfgroup.org/HDF5/release/obtainsrc.html)
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  14 To get the HDF5 C++ API, please see the table below:
  15
  16 | Operating system | Command |
  17 | ---------------- | ------- |
  18 | macOS | Using [Homebrew](https://brew.sh/), `brew install hdf5` |
  19 | Debian and Debian-based OSes | `sudo apt install libhdf5-dev` |
  20 | Red Hat-based OSes | `sudo dnf install hdf5-devel` or `sudo yum install hdf5-devel` |
  21 | Windows | Download precombiled binaries [here](https://github.com/mannau/h5-libwin) |