8c9d2c561fcd6cbb575f2c42035faef137877f13
[loomr.git] / DESCRIPTION
1 Package: loomR
2 Type: Package
3 Title: An R interface for loom files
4 Version: 0.1.0
5 Date: 2017-11-08
6 Authors@R: c(
7   person(given = 'Paul', family = 'Hoffman', email = 'phoffman@nygenome.org', role = c('aut', 'cre')),
8   person(given = 'Rahul', family = 'Satija', email = 'rsatija@nygenome.org', role = c('aut')),
9   person(given = 'Andrew', family = 'Butler', email = 'abutler@nygenome.org', role = c('ctb')),
10   person(given = 'Christoph', family = 'Hafemeister', email = 'chafemeister@nygenome.org', role = 'ctb')
11   )
12 Description: An interface for the single-cell RNAseq-oriented loom format. Loom files are an HDF5-based format for storing and interacting with large single-cell RNAseq datasets. loomR provides an interface for working with loom files in a loom-specific way; we provide routines for validating loom files, iterating with chunks through data within the loom file, and provide a platform for other packages to build support for loom files.
13 URL: https://github.com/mojaveazure/loomR http://loompy.org/
14 BugReports: https://github.com/mojaveazure/loomR/issues
15 Depends:
16   R (>= 3.2.2),
17   R6,
18   hdf5r,
19   iterators,
20   itertools
21 Imports:
22   utils,
23   Matrix,
24   methods
25 Collate:
26     'internal.R'
27     'loom.R'
28     'package.R'
29 License: GPL-3
30 Encoding: UTF-8
31 LazyData: true
32 SystemRequirements: HDF5 (>= 1.8.13)
33 RoxygenNote: 6.0.1